MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022656	TTTGTA	2	12	36	47	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022656	TTA	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022656	TTA	2	6	127	132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022656	AGCC	2	8	566	573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022656	AAAAAT	2	12	581	592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022656	A	6	6	605	610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022656	TTTA	2	8	687	694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022656	TAT	2	6	706	711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022656	CTT	2	6	766	771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022656	TA	3	6	779	784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022656	TTG	2	6	880	885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022656	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022656	A	6	6	951	956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022656	T	6	6	957	962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022656	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022656	A	8	8	996	1003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022656	CCA	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_022656	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_022656	A	6	6	1220	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022656	T	6	6	2671	2676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022656	A	6	6	2679	2684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022656	TCT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022656	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022656	A	6	6	2752	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022656	AATTA	2	10	2765	2774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022656	ATA	2	6	2778	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022656	TAA	2	6	2784	2789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022656	T	6	6	2817	2822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022656	A	6	6	2826	2831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022656	AG	10	20	2857	2876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022656	AAT	2	6	2880	2885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022656	A	8	8	2934	2941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022656	AATTTT	2	12	8254	8265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022656	AAAG	2	8	8296	8303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022656	AGGT	2	8	8322	8329	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022656	CAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022656	TAA	2	6	8361	8366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022656	TAT	3	9	8375	8383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022656	ATA	2	6	8386	8391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022656	TAA	2	6	8395	8400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022656	CTAA	2	8	8501	8508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022656	A	7	7	8541	8547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022656	AATC	2	8	8566	8573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022656	ATAA	2	8	8605	8612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022656	AAAG	2	8	8652	8659	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022656	TAA	2	6	8674	8679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022656	TAT	3	9	8688	8696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022656	TAG	2	6	8700	8705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022656	TAA	2	6	8708	8713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022656	CTT	2	6	8746	8751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022656	ATG	2	6	9637	9642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022656	A	7	7	11134	11140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022656	GAAAAT	2	12	15232	15243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022656	GAA	2	6	15247	15252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022656	TGA	2	6	15270	15275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022656	AGA	2	6	15303	15308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022656	GAG	2	6	15310	15315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022656	TTAAT	2	10	20610	20619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022656	ATT	2	6	20631	20636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022656	ATA	2	6	20637	20642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022656	T	6	6	20651	20656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022656	ATTA	2	8	22082	22089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022656	ATA	2	6	22102	22107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022656	ATT	2	6	22523	22528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022656	TTA	2	6	22529	22534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022656	ATT	2	6	22556	22561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022656	ATT	2	6	22567	22572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022656	ATT	2	6	22578	22583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022656	TAA	2	6	23737	23742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022656	AAT	3	9	23749	23757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.